Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q66JV7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q66JV7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q66JV7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q66JV7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q66JV7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q66JV7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q66JV7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q66JV7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms