Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Knl1Q66JQ7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Knl1Q66JQ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms