Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprjQ64455 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprjQ64455 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprjQ64455 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprjQ64455 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprjQ64455 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprjQ64455 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprjQ64455 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprjQ64455 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprjQ64455 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprjQ64455 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprjQ64455 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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PtprjQ64455 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprjQ64455 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms