Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Irf4Q64287 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Irf4Q64287 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Irf4Q64287 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Irf4Q64287 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Irf4Q64287 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Irf4Q64287 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Irf4Q64287 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Irf4Q64287 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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