Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ifit1Q64282 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ifit1Q64282 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms