Protein–RNA interactions for Protein: Q64267

Xpa, DNA repair protein complementing XP-A cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpaQ64267 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XpaQ64267 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
XpaQ64267 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms