Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Col4a5Q63ZW6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Col4a5Q63ZW6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms