Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nup62Q63850 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nup62Q63850 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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