Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic2Q62520 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Zic2Q62520 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic2Q62520 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic2Q62520 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zic2Q62520 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zic2Q62520 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zic2Q62520 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Zic2Q62520 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Zic2Q62520 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Zic2Q62520 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms