Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vat1Q62465 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vat1Q62465 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms