Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CcncQ62447 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CcncQ62447 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcncQ62447 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms