Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sall3Q62255 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms