Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sycp1Q62209 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sycp1Q62209 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms