Protein–RNA interactions for Protein: Q62170

Selplg, P-selectin glycoprotein ligand 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelplgQ62170 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SelplgQ62170 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
SelplgQ62170 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
SelplgQ62170 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
SelplgQ62170 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms