Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sin3bQ62141 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sin3bQ62141 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms