Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtprrQ62132 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtprrQ62132 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms