Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prkd1Q62101 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prkd1Q62101 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms