Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Npm1Q61937 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Npm1Q61937 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms