Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrrn1Q61809 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrrn1Q61809 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms