Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga7Q61738 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms