Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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AtrxQ61687 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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AtrxQ61687 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
AtrxQ61687 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
AtrxQ61687 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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