Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad21Q61550 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rad21Q61550 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms