Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Abcd2Q61285 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Abcd2Q61285 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms