Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Foxd3Q61060 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms