Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc1Q61056 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Trpc1Q61056 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trpc1Q61056 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Trpc1Q61056 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trpc1Q61056 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trpc1Q61056 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trpc1Q61056 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trpc1Q61056 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trpc1Q61056 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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