Protein–RNA interactions for Protein: Q61009

Scarb1, Scavenger receptor class B member 1, mousemouse

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb1Q61009 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Scarb1Q61009 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scarb1Q61009 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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