Protein–RNA interactions for Protein: Q61006

Musk, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 868 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MuskQ61006 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MuskQ61006 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MuskQ61006 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms