Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Klf3Q60980 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Klf3Q60980 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms