Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
JrkQ60976 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms