Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Neurod1Q60867 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Neurod1Q60867 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms