Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Traf3Q60803 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf3Q60803 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms