Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samhd1Q60710 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samhd1Q60710 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms