Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ItgaeQ60677 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ItgaeQ60677 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms