Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nr1h2Q60644 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nr1h2Q60644 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms