Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tsr1Q5SWD9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tsr1Q5SWD9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms