Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sco1Q5SUC9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms