Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam71bQ5STT6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam71bQ5STT6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms