Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znrf3Q5SSZ7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znrf3Q5SSZ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znrf3Q5SSZ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Znrf3Q5SSZ7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Znrf3Q5SSZ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Znrf3Q5SSZ7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znrf3Q5SSZ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms