Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sft2d1Q5SSN7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms