Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TefmQ5SSK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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