Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A3

Trdv4, T cell receptor delta variable 4 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv4Q5R1A3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trdv4Q5R1A3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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