Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Trappc1Q5NCF2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trappc1Q5NCF2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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