Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vps41Q5KU39 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vps41Q5KU39 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms