Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Taf3Q5HZG4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms