Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ecm2Q5FW85 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ecm2Q5FW85 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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