Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Prkaa1Q5EG47 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prkaa1Q5EG47 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms