Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Nlrc3Q5DU56 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nlrc3Q5DU56 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nlrc3Q5DU56 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc3Q5DU56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms