Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

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Length 525 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp22Q5DU02 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp22Q5DU02 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms