Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTW2

Sfmbt2, Scm-like with four MBT domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt2Q5DTW2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sfmbt2Q5DTW2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sfmbt2Q5DTW2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms