Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chsy3Q5DTK1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms